金匮肾气丸和六味地黄丸都是补肾的中药，其中金匮肾气丸是用来治疗肾阳虚的药物。而六味地黄丸是治疗肾阴虚的药物。金匮肾气丸主要是治疗以腰膝酸痛，或者是半身以下冷痛以及夜间小便频多。六味地黄丸主要是治疗肾阴不足，临床以腰膝酸软，头目眩晕，耳鸣耳聋，盗汗遗精或骨蒸潮热，手足心热以及消渴或者虚火牙痛等症。六味地黄丸和金匮肾气丸的区别是很明显的，都是治疗肾虚，但是六味地黄丸是治疗肾阴虚，金匮肾气丸是治疗肾阳虚。