两者主要有以下的区别：首先，二者发病部位不同：角膜炎发生黑眼球上，结膜炎发生在白眼球上；其次，二者症状不同：角膜炎症状较重，会表现出畏光、疼痛、流泪等表现；结膜炎主要以眼睛红赤，分泌物增多等表现为主；最后，两者疾病预后不同：角膜炎预后较差，容易致盲，应造成重视；结膜炎一般不影响视力，多数预后较好。