自身免疫性脑炎相对普通脑炎恢复期较长。常规恢复需2-3个月，部分患者恢复期长达2年，自身免疫性脑炎于恢复期时仍需进行相关治疗，如,癫痫治疗、精神症状发作治疗、记忆力障碍治疗等。复发患者需进行自身免疫性脑炎相关抗体检测，如曾查肿瘤为阴性需进行肿瘤方面筛查。自身免疫性脑炎患者治疗的时限较长，患者与家属需有充分的耐心。