早起腰两侧酸疼的原因一般有以下几种：1。腰背肌筋膜炎可以造成晨起时腰部两侧的酸疼，大部分是由于劳累、长时间弯腰或者着凉所造成的。2。病人表现出腰肌劳损的情况下也会造成腰两侧的酸痛。3。类风湿也会造成腰部两侧的疼痛。