如果检查子宫附件B超提示有巧克力囊肿，并且囊肿相对较大，过度的刺激是会造成疼痛的，比如跑步等造成，严重会造成囊肿破裂出血或蒂扭转。另一方面如果合并有妇科炎症，比如盆腔炎，附件炎等也会诱发造成附件区疼痛表现。如果巧克力囊肿直径大于5公分以上，有明显症状的是建议经过手术切除的。