肝内胆管结石症状表现有一部分患者症状不明显，或者是症状轻微，仅有上腹部隐痛不适，常在体检或者是因为其他疾病，做彩超等影像学检查时才被发现。还有一部分患者表现为黄疸，肝区和胸腹部疼痛不适，食欲减低，发热等胆道梗阻症状。还有表现为上腹痛寒战，高热，黄疸，严重时可出现全身感染，如脓毒症，感染性休克，结石刺激和胆管炎症状较重，波及到血管时，可造成胆道出血，表现为腹痛，便血或者是呕血。如果是疾病到了晚期，会出现胆汁型肝硬化或者是门静脉高压的症状，如肝脾肿大，黄疸持续且程度加重，腹水，低蛋白血症，食管胃底静脉曲张，消化道出血。