耳深部疼痛原因很多，首先需要到医院检查一下外耳道以及鼓膜情况，是否有耳屎堵塞或者是耵聍的栓塞，如果发现，直接取出即可痊愈，同时还需要查看是否有鼓膜穿孔以及分泌性中耳炎或者是乳突炎，这些慢性炎症刺激都可能会造成耳深部疼痛，如果发现有中耳炎或者乳突炎，首先需要对症抗炎治疗。等待干耳半年以上需要行乳突根治术以及鼓膜修补术，才可以彻底治愈。