治疗口疮最快的方法是在急性期有明显的疼痛。利多卡因凝胶可以适当地应用于溃疡表面，然后和重组牛碱性生长因子一起应用。在一般治疗中，病人应多吃新鲜蔬菜和水果，适应水分补充，保持大便通畅，保证充足的睡眠，防止过度疲劳，加强体育锻炼，增强免疫力，并采取药物治疗。当地病人可用复方洗必泰漱口，然后涂上重组牛碱性纤维生长因子凝胶，口服免疫抑制剂，如转移因子、维生素B、康复新液，并对溃疡造成的红肿和糜烂加用抗生素。