一般轻、中度新生儿肺炎经过合理的治疗不会有后遗症。若是重度肺炎吸入胎粪较多的小孩可能会并发呼吸衰竭、循环衰竭、败血症、脑膜炎等，严重可造成胎儿死亡。治疗后孩子可能会表现出发育迟缓、智力障碍。新生儿如果表现出吸入胎粪的现象应当及时进行气管插管，将胎粪吸引出，减少胎儿病情加重的可能。缺氧的孩子及时给予吸氧措施，防止小孩发生呼吸衰竭。