屎肠球菌和粪肠球菌均属于链球菌科肠球菌属，其中屎肠球菌正常呈圆形而粪肠球菌正常呈圆形或椭圆形，两者从外形上很难进行分辨，但屎肠球菌对培养基的要求较高，而粪肠球菌对培养基的要求较低，是肠道中非常多见的条件致病菌。在治疗上两者也是有区别的，屎肠球菌的耐药性要高一些，需要使用较高级别的抗生素。