圆锥角膜的发生原因目前还不清楚，比较公认的学说就是遗传学说。圆锥角膜有遗传倾向存在，有些在家族里父辈有圆锥角膜，孩子圆锥角膜的概率会比较高。另外就是角膜当中有一种酶比较活跃，酶可以使得角膜的胶原纤维得到溶解，如果纤维得到溶解之后，角膜壁就会软化，慢慢变薄，变薄之后在正常眼内压的作用下，就会发生局部的前凸。圆锥角膜就是角膜从本来球形的状态，变成中间好像小山丘一样的凸起，影响到屈光矫正的质量，会造成视觉的严重下降。还有一些危险因素，比如有的人在圆锥角膜发生之前频繁揉眼，因为有过敏性的结膜炎，频繁的揉眼诱发了圆锥角膜的发生，还有通宵的熬夜，打电子游戏，眼睛可能在免疫力下降的情况下，发生圆锥角膜。还与先天的眼疾患有关，比如唐氏综合征等。