作为一种侵入性的实验，做肠镜是会在一定程度上对肠粘膜导致损害的。在做检查时，肠镜的镜身会和肠道粘膜发生摩擦，粘膜受刺激会表现出充血、水肿，如果摩擦比较严重，粘膜局部也会表现出红、肿、热、痛的炎症症状，甚至也会有引发肠穿孔、肠出血的风险。但是一般由肠镜检查导致的胃肠粘膜损伤，是比较轻微的，可以自我修复。对于比较严重的肠粘膜损伤，可以辩证用药治疗。