甲状腺过氧化物酶是甲状腺微粒体的主要抗原物质，其功能和甲状腺素的合成有关。抗甲状腺过氧化酶的意义是：对慢性淋巴细胞性甲状腺炎(阳性率达90%—95%）、甲状腺功能亢进症阳性率40%—90%不等、原发性甲状腺功能减退症(阳性率65%左右）、SLE等结缔组织病人(阳性率20%—30%，有辅助诊断、疗效考核价值。