长时间服用避孕药的危害主要包括：1、影响血脂、血糖的代谢，时间久了容易造成高脂血症、糖尿病等并发症。2、长时间服用避孕药的人也更容易患高血压病。3、长时间服用避孕药很容易造成病人患血栓栓塞性疾病，包括脑梗、心梗、下肢动脉栓塞等。4、长时间的服用避孕药也有可能造成病人的肝功能损伤。