跑步时脚踝痛，主要考虑以下原因：1、脚踝本身存在基础疾病或异常状况，导致跑步活动时表现出疼痛。2、由于跑步的运动量过大，超过了踝关节负荷，导致踝关节损伤而表现出疼痛。此外，踝关节扭伤表现出肌肉拉伤、跟腱断裂、韧带损伤等表现，建议及时去医院完善CT检查等，系统诊疗，避免延误病情。