艾滋病病毒感染人体以后，要经过漫长的潜伏期，在整个发病过程中表现为艾滋病初期，无症状期以及艾滋病期。艾滋病的初期，机体染上艾滋病病毒后，2到4周，可能会出现一个短暂性的维持2到3周的病毒血症，可以表现为腹泻，往往是自限性的。而到了艾滋病期，由于机体CD4T淋巴细胞计数明显低下，因此可以出现各种各样的机会性感染，如肠道感染反复发生的细菌性痢疾等等，以及恶性肿瘤导致的腹泻。因此。艾滋病腹泻的持续时间在初期是短暂性的，到了艾滋病期，往往可以维持时间长，持续至少一个月以上。