胚胎质量不好的原因有很多，主要从以下方面来进行考虑：一、胚胎或胎儿的染色体异常。二、母体因素，包括：1、全身性的因素：孕妇患有严重的感染、高热、严重的贫血或心衰、血栓性疾病、高血压等，均可影响胚胎的发育。2、内分泌异常：女性内分泌功能异常（包括多囊卵巢综合症、黄体功能不全、高泌乳素血症等）、甲状腺功能减退、糖尿病血糖控制不良等。3、强烈的应激和不良习惯：妊娠期无论严重的躯体（比如手术、直接撞击腹部、性交过频）或心理（过度紧张、焦虑、恐惧、忧伤等精神创伤等）不良刺激。4、过量的抽烟、酗酒：过量的饮用含咖啡因、海洛因等毒品等。5、免疫功能异常，包括了自身免疫功能异常和同种免疫功能异常，均可影响胚胎的发育。三、此外，男子的精液质量也可能影响胚胎的质量不好。