胃肠镜检查遵循的是人体自然腔道。胃镜检查是从口腔进入，经过咽喉、食管、胃、十二指肠球部，、十二指肠降部完成检查。肠镜检查是经肛门进镜，经过直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠，到达回盲部及末端回肠，少部分患者在做肠镜检查时受肠道解剖位置角度的影响，打入气体较多，完成检查后可能会表现出腹胀不适。但适量走动，肛门排气或者放屁后即可快速缓解。因此做胃肠镜检查对身体是没有任何伤害的，而且现阶段胃肠镜检查，还可以选择无痛的方式来检查。