肺部穿刺手术对身体的伤害相对小，多数不留有明显的后遗症，并没有太大的痛苦感。但有时在穿刺过程中也可能会造成一些并发症，如造成呼吸困难、胸闷、胸痛等气胸表现，甚至可能造成张力性气胸、大咯血等危及生命的并发症。此外，如果是肺部肿瘤的病人行肺穿刺活检，在少数情况下可能会造成肿瘤沿着针道的转移。故在操作过程中，病人一定要配合好医生，表现出任何不适及时告知医生。