肺结核的病原体是结核分枝杆菌。人体感染结核分枝杆菌之后，由于免疫力下降等因素，毒性强的结核杆菌就会在局部聚集大量繁殖，产生的代谢产物破坏肺部正常组织，形成坏死，坏死呈干酪状，就是多见的结核病灶，干酪样坏死进一步发展，组织溶解就形成了肺结核空洞。经过治疗后，结核杆菌毒性变弱，病灶逐渐钙化纤维化，肺结核走向痊愈。因此，肺结核发病和痊愈都围绕结核分枝杆菌的活动而表现出。