肝功能异常患者有可能存在病毒性肝炎，酒精性肝病，脂肪肝，药物性肝病，自身免疫性肝病，血吸虫肝病，代谢性肝病及肝脏肿瘤等，提示有肝细胞损伤，可以继续选择做查找肝损伤病因的相关检查。可以进一步检查甲肝抗体，乙肝两对半，乙肝病毒DNA，戊肝抗体，丁肝抗原，丙肝抗体，丙肝病毒RNA等相关的病毒性肝炎标志物以排除病毒性肝炎。还可以查血脂，自身免疫肝病相关抗体，ANA（抗核抗体），免疫球蛋白，血吸虫抗体，铜蓝蛋白，甲胎蛋白等生化指标，排除脂肪肝，酒精肝，药物性肝病，自身免疫性肝病，血吸虫肝病，代谢性肝病及肝脏肿瘤等。同时还需要做肝脏B超或CT、核磁共振等影像学检查排除肝脏肿瘤性病变，必要时可在超声引导下做肝脏穿刺病理检查。