肛门痛由于病因不同，服用的药物也是不一样的。若是痔疮造成的肛门疼痛，正常情况下可以服用化痔丸、草木犀流浸液片等药物进行治疗。若是肛裂造成的疼痛，可以服用布洛芬等非甾体类消炎药物治疗。若是肛周脓肿等原因造成的疼痛，在使用有效的抗生素治疗的同时，可以配合服用止疼药物治疗。