直肠镜和肠镜是使用不一样的器材。直肠镜往往是在肛肠科医生会常用一点，他们只是观察直肠跟少量的乙状结结肠的这个范围。肛门镜，它主要是观察直肠的这一段范围，也会观察到乙状结肠的下段的少量的一个范围。那么肛肠科医生，他会习惯用直肠镜或者是用肛门镜，因为他们的专科范围也就在这一段大概10公分的范围。结肠镜，是消化科医生的工具，它是观察从肛门到阑尾大概1。5到2米范围的这段肠道的病变。因此它们的镜子的外观是不一样的，它们用途目的都不一样。总体来说，直肠镜主要是观察直肠跟部分乙状结肠的病变，而结肠镜是主要观察整个大肠的病变。