病毒性扁桃体炎的治疗一般不用抗生素。可以用清热解毒的中成药，如蒲地蓝消炎口服液、双黄连口服液、小儿柴胡退热口服液等等。也可以用西药类的抗病毒药物，如利巴韦林喷雾剂、阿昔洛韦等等。针对造成发热的症状，在高热时可以用布洛芬、对乙酰氨基酚退热。病毒性扁桃体炎经过治疗，一般五到七天能够痊愈。治疗期间注意多喝水，多休息，适当运动，增强体质，注意随天气变化增减衣物。