牙根发黑的原因比较多，首先口腔滞留的食物没有得到及时清除造成牙菌斑的积累，长时间就会表现出牙根发黑的表现，这种情况时间长了就容易形成牙龈结石。此外会因为习惯性问题所造成，比如长时间使用咖啡、红酒、抽烟、喝可乐这些不良的有色素的物质，都会造成症状表现出。还有一部分人群是因为牙根部位的牙齿龋齿，造成细菌性感染造成的颜色变化。