月经结束后腰痛的严重，可能的原因主要包括：1、和女性生殖系统有关的腰痛：如患有盆腔炎、生殖系统肿瘤、盆腔淤血综合症而造成腰痛的症状；2、泌尿系统疾病造成的腰痛：如泌尿系统结石影响了尿液的排出，造成肾积水，造成腰痛。3、腰肌劳损造成的腰痛，在活动后或者卧硬板床休息后可以有所缓解。