接种肺炎疫苗三天以后发烧，应当考虑疫苗与人体之间的免疫反应引起。肺炎疫苗实际上就是用减活或者灭毒的肺炎链球菌制成的具有抗原性的制剂，制剂里面的菌体跟肺炎的菌体是完全一样的，只不过失去了活性和侵袭力。通常疫苗当进入人体后，由于表面的细菌膜上带有蛋白，或者蛋白多糖，蛋白多糖就可以和人体发生免疫反应，和细菌进入人体是一样的，只不过这部分细菌不能够扩散，也不能够侵袭人体，很快就被免疫系统清除，大概2-3天左右发生，清除的时间也需要1-2天左右。所以这种情况下可以再观察2-3天，如果体温退了就没有问题，如果还是有体温升高，需要去医院就诊给予相应的处置。