扁桃体癌早期的症状为咽部出现不适感、异物感，并且一侧咽部可出现疼痛感，一般在做吞咽动作时疼痛感会比较明显。进入晚期阶段后疼痛感会逐渐加剧，并会引起同侧反射性耳痛。另外，由于一侧扁桃体迅速增大，容易造成吞咽困难、讲话含糊不清以及呼吸困难等症状。此外，部分患者的肿瘤表面可破溃，出现痰中带血的症状。若伴随颈部淋巴结转移，可在颈部发现肿块。