幽门螺杆菌是造成上消化道疾病的独立的危险因素之一，因此当感染该细菌时会表现出上消化道症状，比如上腹痛、上腹不适感、反酸、烧心、恶心呕吐等。这是由于当幽门螺杆菌感染病人会表现出慢性胃炎、胃溃疡、胃癌等疾病，因此会表现出以上的消化道症状。还有一少部分人群只是单纯的幽门螺杆菌化验(+，并没有明显的消化道症状，这一类人群需要严密监测。