治疗小丘疹，首先要判断它是属于传染性疾病，还是过敏性疾病。如为变态反应性小丘疹，可局部外用糖皮质激素，可外用丁酸氢化可的松乳膏，或糠酸莫米松乳膏等，同时需口服一些抗组胺药。如因感染而形成的小丘疹，如感染了人乳头瘤病毒而形成的扁平疣，则需外用抗病毒药物，如外用干扰素凝胶或维a酸乳膏等。并可适当口服一些免疫调节剂，如转移因子胶囊等。