磁共振对于头部及其颅内器官的绝大多数问题都是可以查出来的，因而磁共振对于脑颈的检查具有很大的优势，如脑颈部是否存在有肿瘤、出血、梗塞或是血管畸形等问题，磁共振在脑部的应用非常广，例如有脑血管 、脑功能检查 、垂体、眼眶、鼻子及鼻窦、颞颌关节、耳部、鼻咽部、口咽部、喉及甲状腺、颈部大血管等是否有肿瘤、出血等等。