较为有效的是常规化治疗和诱导因素治疗。药物治疗中主要使用中和胃酸、抗酸药和抑酸药如H2受体拮抗剂和质子泵抑制剂等。目前临床上公认的首选药物为质子泵抑制剂，其起效快，抑酸作用强且时间长、服用方便，因此在喉咽反流的抑酸治疗中占据主导地位，治疗有效后应逐渐减量。有研究表明，长疗程治疗对于患者的根治效果更佳明显。代表性药物是奥美拉唑、雷贝拉唑等药物。