反流性食管炎的治疗，不存在最好的治疗药物，但是需要根据疾病的原因以及患者的临床表现，使用促进胃肠蠕动的药物、抑制胃酸分泌的药物以及抗酸药物。临床当中比较常用的药物类型有多潘立酮、莫沙必利、西沙必利、依托必利、奥美拉唑肠溶胶囊、潘托拉唑肠溶胶囊、雷尼替丁、法莫替丁、西米替丁等药物，部分的患者还可能需要使用根除幽门螺杆菌感染的药物，促进疾病的缓解。该疾病的治疗除了使用药物治疗以外，也需要患者养成良好的生活习惯，避免进食高脂肪食物或者巧克力、浓茶、咖啡等。