由于卵巢囊肿的性质不同，因此其疾病就会有所不同，如果只是普通的卵巢囊肿，那常常就是由于体内高水平的雌孕激素刺激造成卵巢上的囊性暗区表现出。若是在排卵后表现出卵巢囊肿，而在月经干净后又消失，那就要考虑是生理性的黄体囊肿，这并不是属于疾病，如果有卵巢囊肿的同时，还有进行性加重的痛经，那就要考虑是子宫内膜异位到卵巢上形成的卵巢巧克力囊肿。