卵巢囊肿一般选择在月经干净3~7天做手术。卵巢囊肿是属于妇科比较多见的疾病，一般是在体检或者是妇科检查的时候发现的，如果囊肿不大不超过5个厘米，可以口服药物或者定期复查。如果囊肿比较大，大于5个厘米，经过口服药物不缓解的话，建议手术治疗，这是属于妇科比较多见的手术。