做胃镜痛苦程度主要跟病人的耐受度、配合程度和胃镜的方式及操作医生的熟练程度有一定关系；胃镜分为无痛胃镜和普通胃镜，如果做无痛胃镜，即在静脉麻醉下行胃镜检查，病人一般无痛苦；如果选择做普通胃镜，病人清醒状态下行胃镜检查，全程大约40分钟，开始镜子进入时可能会表现出不适，但病人一般可以耐受，退镜子时一般无明显不适。