中枢神经系统疾病主要包括脑血管疾病、神经系统变性病、中枢神经系统感染性疾病、中枢神经系统脱髓鞘疾病、运动障碍性疾病、癫痫、脊髓疾病、神经系统遗传性疾病、神经系统发育异常性疾病、中枢神经系统中毒性疾病、中枢神经系统肿瘤性疾病、中枢神经系统免疫性疾病等。其中比较多见的是脑血管疾病，包括缺血性脑血管病和出血性脑血管病。其次是神经变性病、感染、癫痫以及运动障碍性疾病。