龟头炎的药物治疗需要根据造成龟头炎的病因不同而选择不同的药物。若是念珠菌性龟头炎，那么就需要使用碳酸氢钠溶液冲洗，然后涂抹特比萘芬软膏，或者是氟康唑软膏进行治疗，4到8周为一个疗程。若是普通的病原微生物感染造成的，那么可以使用百多邦药膏或者是甲硝唑药膏局部涂抹进行治疗，1到2周为一个疗程。如果因为内裤摩擦刺激，或者是化学物品造成的龟头炎，则可以使用尿素软膏或者曲安奈德软膏治疗。