马凡综合的治疗现阶段无特殊治疗方法。当机体某个部位表现出危及生命的情况，可以行手术治疗维持生命，但不能达到根治的疾病目的。表现出危害心脏及大血管的病变，多见病为主动脉夹层和瓣膜病变，手术主要是置换人工血管和心脏瓣膜。也可以使用治疗心脏病的药物来降低心室排血和减轻主动脉压力。眼睛表现出晶体脱落或半脱落，可行手术置换晶体。胸廓变形、鸡胸、漏斗胸、脊柱及血管有病变，可以行手术矫正减缓病情发展。