食管反流基本病因：第一、抗反流功能的下降，这类病人往往有食道下括约肌的异常或胃食道交界处的结构的异常，比如食道裂孔疝，这些异常或者改变会导致抗反流功能的下降，胃内容物容易发生反流。第二、食管清除能力的下降。第三、食管黏膜防御屏障的作用减弱，第四、食管感觉的异常。第五、胃排空的延迟。还有，如婴儿和肥胖的妊娠容易发生反流，而且硬皮病、糖尿病、腹水、高胃酸分泌的状态也常常有胃内容物的反流，十二指肠胃食管反流也是一个病因之一。