自身免疫性脑炎若能早发现、早诊断、早治疗，可提高治愈率。治疗方案为使用激素和免疫球蛋白，若效果欠佳，可用血浆置换法。临床上患者在激素治疗和免疫球蛋白治疗后，病情即可得到极大改善。以上两种治疗方法仍不见效的患者，血浆置换效果仍不良。针对癫痫发作，可使用较多镇静药物联合几种抗癫痫药物进行治疗。若患者存在精神行为异常，需要使用抗精神药物进行治疗。病情治疗过程中，若出现意识障碍或引起昏迷，则需进行气道保护措施，如气管插管、预防肺部感染治疗等。