胰腺囊腺瘤最佳的治疗方法是手术切除。其原因如下：胰腺囊腺瘤对放射性治疗以及化学药物治疗均不敏感，而且胰腺囊腺瘤肿瘤增大后，会压迫被十二指肠以及横结肠，可导致腹部有持续疼痛以及肠梗阻的症状，采用手术切除肿瘤可以预防肠梗阻等。此外，手术还可以预防胰腺囊腺瘤发生肿瘤破裂，急性胰腺炎以及糖尿病等严重后果，所以经过手术切除是最佳的治疗方法。