肺部隐球菌治愈率和病情严重程度及治疗反应有关。如发现的比较早，治疗及时且隐球菌未感染至中枢神经系统，经过合理足疗程的抗真菌治疗，其治愈率是非常高的。但如未及时诊治，造成隐球菌播散至大脑，因其破坏强，治疗效果不佳，治愈率明显下降，死亡率也增高。故肺隐球菌要早发现、早期规范的足疗程治疗，治愈率才能明显提高。