肺栓塞的临床表现缺乏特异性，许多症状同时也可以出现在其他的疾病当中。相对有特异性的是临床上所谓的肺栓塞三联症，指呼吸困难，胸痛和咯血，但是总体发生率较低，不足30%。这些症状是由于肺动脉栓塞导致肺血管床明显减少，肺动脉压力增高，部分肺组织出现肺梗死等因素导致，由于其发生率低，故临床意义有限。诊断还可以结合其他的临床表现以及特异性的体征，比如肺动脉瓣区第二心音亢进或者分裂，P2＞A2，以及肺动脉CT血管造影等进行明确。