肠病按照病程长短来分，可分为慢性肠病和急性肠病；按照发病部位又分为大肠疾病和小肠疾病；按照病变累及范围又分为器质性病变和功能性病变。最后一种分法较为多见。功能性肠病包括肠易激综合症、习惯性便秘、功能性消化不良等。器质性肠病包括溃疡、肠梗阻、肠道肿瘤、炎症性肠病、肠结核等。