肝内胆管炎最常见的临床表现是腹痛，多表现为中上腹不适、胀痛，或呈绞痛发作，进食油腻食物后可加重，很少有发热和黄疸，腹部体征不明显，可仅有上腹轻压痛，胆囊不肿大。如发生急性发作，则出现腹痛、寒战高热和黄疸等三联征。胆管炎的患者多有消化道的症状，表现为腹胀、恶心、呕吐等，梗阻性胆管炎的患者可有大便发白，呈陶土样改变。急性梗阻性化脓性胆管炎的患者，上述症状外，还可出现休克，神经中枢系统受抑制的表现，例如心率加快、血压下降、脉搏细促、患者神志淡漠、谵妄、昏迷等。