半夜里咳嗽一般和食道或呼吸系统有一定关系。夜间迷走神经兴奋性增高，容易表现出咳嗽。如果平常有胃胀、嗳气、反酸等胃肠道症状，加上半夜刺激性咳嗽，考虑胃食管的反流，平躺时胃酸反流到气道当中。平常经常有咳嗽、气喘、痰中有血丝、潮热，需要考虑哮喘或肺结核，夜里会表现出咳嗽症状加重。建议您正规三甲医院呼吸科和消化科就诊治疗。