精子畸形率高的治疗在临床上主要对应对症选择治疗方法，比如精索静脉曲张造成的精子畸形率高，可以经过微创手术来治疗。经过手术后，精索静脉的血液循环改善后，不再影响到睾丸的生精功能，睾丸产生的精子正常，精致的畸形率也就恢复到了正常。若是长期酗酒或者长期熬夜或者接触一些有毒物质，还有一些男性长期服用一些药物，都可影响到精子的畸形率。可以改善生活习惯，戒烟戒酒，防止熬夜或者停止服用药物，精子畸形率也都可以得到改善。