一般而言，益生菌可在一周至四周内使用。益生菌主要起到调节胃肠功能的作用，一般经过一月左右的调理，肠道功能基本可以恢复。若患者经调理后胃肠功能改善，排便正常，可停用。在有害细菌较多的情况下，肠道内会有较多的有害细菌，会表现出腹痛、腹泻等表现，使用益生菌调理肠胃后，当益生菌逐渐占据上风，人体会开始感到病情好转。