牙周脓肿一般不会自愈。牙周脓肿的病因是由于深牙周袋中的细菌形成了化脓性炎症，脓液无法排出形成。一般发生牙周脓肿的患者都有严重的牙周病，根分叉暴露，不易清洁，最终形成牙周脓肿。牙周脓肿需要行脓肿局部切开引流，将脓液排出来，冲洗清理干净，这样牙周脓肿才能愈合。牙周脓肿治愈后，要进行完善的牙周治疗，彻底消除致病因素。严重的需要进行翻瓣手术，将根面平整，去除感染物及炎性组织，否则牙周脓肿容易反复发作。